В Африке живут сухопутные Testudinidae (4 рода с несколькими видами) и мягкокожистые Trionychidae (2 эндемичных рода) черепахи, пеломедузы Pelomedusinae. Последние распространены в Африке, на Мадагаскаре и в Южной Америке.
Все еще многочисленны в этой области и крокодилы. Африканские крокодилы относятся к 2 родам и ведут преимущественно водный образ жизни, изредка заходя и в соленые воды.
Из амфибий, обитающих в Эфиопской области, следует назвать эндемичных Phrynomeridae (род шпорцевых лягушек Хеnopus из липовых), своеобразных жаб (например, лазающая ночная жаба Nectophryne с липкими дисками на пальцах и живородящая жаба Nectophrynoides), многочисленных настоящих лягушек, ракофорид, или веслоногих, встречающихся также в Азии, узкоротов Breviceps и крайне необычных волосатых лягушек Astylosternus (у самцов в брачный период по бокам и на бедрах появляются длинные волосовидные выросты кожи). Хвостатых амфибий здесь нет, их заменяют червяги, характерные для тропиков всего мира, кроме Австралии.
Удивительны пресноводные рыбы Эфиопской области. Это представители древних групп — кистеперые Polypteridae, эндемичное семейство с родами многопер и каламоихт. Своебразие этих рыб так велико, что специалисты относят их к особому отряду или даже подклассу. Живут в водоемах Африки и двоякодышащие рыбы рода Protopterus. В засушливый период, когда вода во временных водоемах пересыхает, протоптеры, зарываясь в ил, впадают в спячку, которая продолжается 6—9 месяцев. Протоптеры относятся к семейству чешуйчатниковых Lepidosirenidae. Один род этого семейства Lepidosiren живет в пресных водах Южной Америки.
Немало в Эфиопской области и эндемичных семейств рыб, принадлежащих к примитивному подотряду Isospondyli (кнерие-вые, кромериевые, фрактолемовые и др.). Из костноязычных рыб в Африке живут рыбы-бабочки Pantodontidae, узкорылые Мог-myridae, гимнарховые Gymnarchidae. Гимнархи могут испускать электрические импульсы. Такой же способностью обладают электрические сомы Malapteruridae, единственный представитель которых живет в Ниле и в водоемах Конго. Сомы вообще чрезвычайно обильно представлены в Африке, их не менее 6 семейств и около 250 видов. Многочисленные семейства пресноводных рыб Эфиопской области указывают на фаунистические связи ее с Южной Америкой (Characidae, Cichlidae) или с Индо-Малайской областью (Anabantidae — лабиринтовые). Как и везде в тропиках, в области нет лососевых и щуковых.