Выше уже указывалось, что не все особенности географического распространения животных объясняются влиянием современных условий. Фаунистические комплексы развиваются во времени, и тот раздел каузальной зоогеографии, который пытается объяснить современное распространение животных причинами, действовавшими в прошлом, называется исторической, или генетической, зоогеографией. К числу таких причин относятся бывшие материковые соединения, изменения климата и растительного покрова в минувшие геологические эпохи и т. д.
Все разделы зоогеографии представляют собой единое целое и отличаются только подходом к толкованию фактического материала, предоставляемого описательной и сравнительной зоогеографией.
Направления зоогеографических исследований весьма разнообразны. Основными из них являются следующие: ареалография — учение о типах ареалов, их структуре и происхождении; фаунистика — исследование видового состава фаун в сравнительном аспекте; географическая зоология — изучение распространения отдельных систематических единиц (например, змей, грызунов, дневных бабочек и т. п.); экологическая и историческая зоогеография (говорилось выше); геозоология, изучающая весь комплекс животных (зооту) в ландшафте или ландшафтной зоне. Последнее направление широко применяет количественный учет как метод исследования и дает основу для разнообразных практических мероприятий. Геозоологию в равной мере можно отнести и к зоологии, и к географии, именно к ландшафтоведению.